[No.H100]
3月6日消息,據(jù)外媒報道,谷歌旗下人工智能(AI)部門DeepMind正在加入全球努力,以幫助了解更多關(guān)于新型冠狀病毒的信息,這種病毒引發(fā)的疫情正在世界大部分地區(qū)迅速傳播。
谷歌的英國研究團(tuán)隊剛剛使用DeepMind的新深度學(xué)習(xí)系統(tǒng)AlphaFold預(yù)測新型冠狀病毒的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。該系統(tǒng)使用被稱為“自由建模”的機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù),當(dāng)沒有類似的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)可用時,它可以自主生成新的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。
據(jù)最新統(tǒng)計,世界各地的科學(xué)家都在竭盡全力了解這種新病毒,DeepMind的發(fā)現(xiàn)希望減少確定病毒蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的時間。
DeepMind發(fā)布的博客文章指出:“了解蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)將為了解其功能提供重要線索,但確定結(jié)構(gòu)的實驗往往可能需要幾個月或更長的時間,有些實驗甚至被證明難以獲得結(jié)果。為此,研究人員始終在開發(fā)從氨基酸序列預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的計算方法。在類似蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)已經(jīng)被實驗確定的情況下,基于“模板建模”的算法能夠提供對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的準(zhǔn)確預(yù)測。”
文章中還稱:“我們最近發(fā)布的深度學(xué)習(xí)系統(tǒng)AlphaFold專注于在沒有相似蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的情況下準(zhǔn)確預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),這種方式被稱為“自由建模”。自推出以來,我們始終在持續(xù)改進(jìn)這些方法,并希望提供最有用的預(yù)測,所以我們分享了使用我們新開發(fā)的方法生成的SARS-CoV-2中某些蛋白質(zhì)的預(yù)測結(jié)構(gòu)。”
值得注意的是,DeepMind的結(jié)構(gòu)預(yù)測系統(tǒng)仍在開發(fā)中,他們不能確定所提供的結(jié)構(gòu)的準(zhǔn)確性,盡管他們相信該系統(tǒng)比早期的CASP13系統(tǒng)更準(zhǔn)確。DeepMind證實,其系統(tǒng)為蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中共享的、經(jīng)過實驗驗證的SARS-CoV-2尖峰蛋白結(jié)構(gòu)提供了準(zhǔn)確的預(yù)測,這讓他們相信對其他蛋白質(zhì)的模型預(yù)測可能是有用的。
鑒于“疫情的潛在嚴(yán)重性和時間敏感性”,DeepMind表示,該公司正在跳過通過實驗驗證發(fā)現(xiàn)的過程,或者在發(fā)表之前等待學(xué)術(shù)期刊的同行評審。這與其他科學(xué)研究相一致,因為這個過程可能需要幾個月的時間。
博客文章中還稱:“我們需要強(qiáng)調(diào)下,這些結(jié)構(gòu)預(yù)測還沒有經(jīng)過實驗驗證,但希望它們能有助于科學(xué)界了解病毒是如何發(fā)揮作用的,并為未來開發(fā)療法的實驗工作提供假說生成平臺。我們感謝許多其他實驗室的工作:如果沒有全球研究人員的努力,這項工作是不可能完成的。”
文章補充道:“通常情況下,我們會等到一家學(xué)術(shù)期刊對這項工作進(jìn)行同行審查后再發(fā)表相關(guān)發(fā)現(xiàn)。然而,考慮到情況的潛在嚴(yán)重性和時間敏感性,我們將按照現(xiàn)在的情況發(fā)布預(yù)測的結(jié)構(gòu),并以開源的形式推出,這樣任何人都可以使用它們。”開源將允許任何研究人員在DeepMind發(fā)現(xiàn)的基礎(chǔ)上進(jìn)行改進(jìn)或分享。
谷歌在2014年斥資4億英鎊收購了總部位于倫敦的DeepMind,該公司此前曾使用AI推動醫(yī)療保健領(lǐng)域的進(jìn)步,開發(fā)用于識別眼病和檢測宮頸癌的模型。(騰訊科技審校/金鹿)
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